崩壊した世界で、人類を守るのは巨大なタイタンを召喚できる「覚醒者」だけ。
家族から見捨てられ、居場所を失った青年ブルースは、ある日、史上最高ランクのSSS級プライム・タイタン「ユニット001」を召喚する。
圧倒的な力で怪獣ゼロを撃破したブルースは、再びア連盟へと帰還。
そこで偶然にも、危機に陥っていた妹リンダを救い、かつて自分を捨てた実家を守ることになる。
しかし、名門チャールズ家との対立が激化する中、ブルースの秘められた力と過去が次第に明らかになっていく。
最強のタイタンを従えた男の帰還が、家族の運命を変え、連盟の勢力図をも大きく塗り替えていく――。
